Voor documenten die openbaar worden gemaakt, is er de mogelijkheid om persoonsgegevens en commercieel vertrouwelijke informatie te beschermen tegen openbaarmaking (zie CTR artikel 81, lid 4).
Voor deze documenten kan een versie ‘voor publicatie’ worden ingediend waarin gegevens zijn geredigeerd, en een versie ‘niet voor publicatie’ waarin geen gegevens zijn geredigeerd. De geredigeerde versie moet dan eerst worden geüpload, gevolgd door de schone versie. Alleen versies ‘voor publicatie’ zullen openbaar worden op het tijdstip volgens de voorschriften voor openbaarmaking. Een groot deel van het dossier zal nooit openbaar worden, de betreffende secties in CTIS bevatten dan ook niet de genoemde optie voor het indienen van twee versies.
Zie ook sectie 2.1 van het CTIS Sponsor Handbook van de EMA.