De CCMO is belast met het erkennen van en toezicht houden op de werkzaamheden van erkende medisch-ethische toetsingscommissies (METC’s).

De toezichthoudende taak van de CCMO is in drie categorieën te verdelen: toezicht vooraf (zoals de beoordeling van reglementen, de deskundigheid en onafhankelijkheid van de leden van erkende METC’s), for cause toezicht (naar aanleiding van incidenten, meldingen, signalen en degelijke) en doorlopend toezicht (monitoring van de kwaliteit). Hierbij staat het continue verbeterproces van de erkende METC’s centraal.

De CCMO is in 2011 gestart met doorlopend toezicht. Deze vorm van toezicht is met name gericht op de basisprincipes van de medisch-ethische toetsing, het zichtbaar maken van wezenlijke en kwetsbare punten van het toetsingsproces en het stimuleren van zelfreflectie bij de erkende METC’s. In haar jaarverslagen bericht de CCMO over haar toezichtacties in de betreffende periode.